卫指挥同知牛国统掌握的200镇江卫官兵等等等等，林林总总加起来也有3~5000人，其中以吴淞营总兵方国安部最为精锐，危险性也最大。
所以，在不确定巡江水师狼山营是否有变的情况下，朱由崧只能先把济州水师桨帆船队调回镇江待命，一待济州水师桨帆船队到位了，那么接下来金吾营辅军师就会抽调部分兵马配合锦衣卫，武装抓捕侯方域供述名单上的那些统兵将领；而只有完成了对这些统兵将领的抓捕，清除了南京周边的隐患后，朱由崧才会安排金吾营辅军师主力及济州水师展开对吴淞营的打击----为了避免方国安率部东逃出海，朱由崧甚至密令济州水师主力南下长江口封堵，不过，济州水师主力南下是需要时间的，这也是为什么朱由崧最好才对付方国安的原因之一。
当然，侯方域的供词未必是真实的，他提供的名单上的人也许是冤枉的，但现在这个时候，有杀错没放过，了不得，日后把责任推到侯方域和东林党头上，再给枉死者及受到连累的家人、族人进行平反嘛。
“另外，飞马将阿济格部北上之事，通报给高杰、尚可喜、刘肇基知晓，命令高杰所部，止步于光（州）、颍（州）两地，尚可喜所部止步于陈（州）、亳（州）两地，刘肇基所部止步于归（德）、睢（州）。”等完成长江两岸的军事调动后，朱由崧继续命令道。“一待控制上述州府后，各军就地强化城防，不得再行冒进，以免遭到阿济格部的蓄意打击。”
朱由崧说到这，顿了顿，又命令道：“再通知张国维，一旦结束对左部的押运、看守任务，所部江西卫所兵立刻循陆路驰援长沙、岳州一线，以确保湖南门户不失去，并在朕亲领大军收复武昌后，协同孙传庭部北上夺取荆州重镇······”