但是这穿越神器还有些缺憾，玻璃中含有大量的细微气泡，密密麻麻――虽然不影响使用，却严重影响外观。
实际上真正的彻底无色、透明的玻璃制品，在17世纪的任何时空里都是不存在的。早期玻璃制品有偏色和气泡都是常见的现象。即使现代的玻璃制品，也并非绝对不含气泡，只不过数量极少不易察觉而已。对于见惯了现代玻璃器晶莹透明的穿越众来说，眼前的的原料还是略显粗糙了。
于是下一步的工作就转入到脱去气泡的工作中去了。脱去气泡，在玻璃业中术语叫“澄清”，有人模模糊糊的记得，澄清是要加入澄清剂的。但是没人知道具体澄清剂是什么东西。
除此之外，记得搅拌也是去除气泡的工艺，二者或许可以结合起来使用。
人们隐约记得，砒霜似乎是一种澄清剂。这种剧毒药品在任何时空都很难到手。好在以前郭逸按照农业部门的要求，早就把广州城的砒霜搜购一空了――吴南海本打算是用它来浸种用。
所谓砒霜澄清，是向玻璃液中加砒霜，当砒霜进入玻璃液后，由于高温而生成蒸汽，这些砷蒸气在玻璃浆中是以大气泡的方式存在的，大气泡在搅拌玻璃浆的过程中会逐渐吸收分散在周围的小气泡，最终将小气泡带走。
这种方法的确是可行的，但是灼热的玻璃液中加入砒霜，升华成剧毒的砷蒸气，工艺过程中的污染实在太恐怖了。玻璃攻关小组领了几个口罩和防毒面具，开始了第一次试验。
玻璃液融化之后，玻璃工们的人先扔了一些研碎的硝石到坩埚里面去进行脱色。然后开始不停地对玻璃浆进行搅拌，坩锅的是有盖子的，搅拌的钢钎只能通过盖子上的洞进行，非常费力，不一会就累得人满头大汗。每搅拌一个小时，就放些砒霜进去，同时继续搅拌。
最终获得的玻璃相当的澄清，但是原料的消耗实在让人乍舌――用掉了差不多整整一公斤砒霜。
一公斤的砒霜，全广州城药店里的砒霜都没来也没五六公斤。按这个效率生产，他们还得建立一个砒霜工业才能支持玻璃产业的大规模生产。
显然这个办法极不经济。群策群力的出谋划策之后，又有人提出了过去从小说里看来的一种澄清法：水泡木强迫沸腾法。――用钢钎将水泡木强行插入玻璃液中，使其沸腾，带走其中的气泡。
这个所谓的水泡木倒是比砒霜好找。博铺岸边泡烂的木头多得很，赶紧去找一些来。用钢钎戳着狠狠的往玻璃液里按了下去。
当时的情况据在场者说就好像放了烟花一样，红热的玻璃液顿时飞炸开，喷得到处都是，幸亏在场的人都穿着炼钢工人的石棉防护服，否则就要有人进医院了。
提出这个建议的人被大家批斗半小时，当然他是很委屈的――这个又不是他捏造出来的。不过生产工艺并非仅仅靠简单的描述就能模仿出来，既然没有资料详细说明这个工艺到底是怎么操作的，只能暂时停止继续试验了。
如此折腾了好几次之后，终于有人从“大图书馆”里的超星电子书中找到了一本玻璃制造手册，查询到了如何去除气泡的工艺：首先是加入澄清剂――砒霜的确是可以的，其实食盐也能用，加入之后再结合搅拌。
搅拌也不仅仅是拿着钢钎去搅就可以了。而要在玻璃坩锅内放入搅拌器，这是一个用耐火泥制成的中空的圆筒，用一根带钩子的钢钎操作在玻璃液内移动。只要搅拌的时间足够长，不仅绝大多数气泡能够消失，玻璃液中的条纹和结石也终将全部消失，玻璃液就会变得完全匀称透明――早期的光学玻璃就是采取这个方法来制造的，用来制造商业级玻璃器当然更不在话下。
果然，按这样的操作方法操作再次将坩锅取出之后，玻璃液中的气泡几乎完全消失。整个玻璃液的黏稠度也减低了，玻璃液变得十分匀称，流动顺畅。这种玻璃甚至可以用来做要