从他们发现藏羚羊被残杀开始，为了调查残杀藏羚羊背后的偷猎者，他们顺着路线进入了城区，又顺着线索找回了草原上。
最后发现是保护站的人被金钱蛊惑给对方提供了珍惜物种的生存地点，才有了后面那些偷猎者猖狂捕猎的事。
那人发现暴露之后挟持了小宝，带着小宝跑了。
偷猎者本来要杀了小宝泄愤，但因为平时在保护站里小宝就最喜欢这个叔叔，那人心软保住了他，答应把他给人贩子。
但其实，背叛者偷偷把小宝藏了起来，并且留了消息让自己的朋友过来接孩子，自己因为偷偷放跑小宝被偷猎者打了个半死。
男主不眠不休找寻偷猎者的踪迹，设下圈套引诱对方，终于把他们一网打尽之后发现不见小宝。
背叛者因为重伤早就被抛弃，对方说小宝已经死了刺激男主，男主崩溃失去心理防线被对方偷袭。
他们全部被击杀，可男主也因为伤势过重没有救过来。
故事的结局是，一个大学生来到了可可西里动物保护站，在签到栏里，写下了自己的名字。
——长安。
当年死里逃生的少年重新回到了自己热爱的地方，假以时日，他也会成为这草原上最烈 的鹰隼，然后带着自己的盼望，飞翔遥远的天空。
不给他姓氏，是不想让他被姓氏束缚，强迫性的要求自己去做一些什么事，男主希望小宝是自由的。
其实关于可可西里的故事有很多，也有很多不俗的电影横空出世，这个剧本听起来可能并不是那么的动人，但被看好的地方就是在与那些没有办法被讲述出来的东西上面。
那是一种更高层次的感情，人与自然的救赎，人与动物的相互治愈，还有热爱和自由。
很多东西混聚在一起，才有了这么精彩的一个剧本，让人看了第一眼就欲罢不能。
其实一开始赵棠棠想过要不要写一个圆满大结局，可是当那个结局被写出来的时候，总感觉有什么东西不对劲，好像有一种被束缚住了的感觉。
所以她改动了结局，两版剧本都发了过去，毫无疑问，导演也选择了现在这一版。