里世界中相传，在横滨某处，藏着一本空白的书，写在上面的故事会变成现实，前提是写下的必须是一个完整的故事。
横滨有三大组织——异能特务科，武装侦探社，港口黑手党。
他们由传说中的异能者——夏目漱石指点，构成三刻构想，共同守护着横滨。
异能特务科掌管白日，武装侦探社掌管黄昏，港口黑手党掌管黑夜。
异能特务科最高指挥官种田山头火，武装侦探社社长福泽谕吉，港口黑手党首领森鸥外。
三大组织各有强者。
异能特务科——
坂口安吾，身负异能「堕落论」，可读取残留在物品上的记忆。
“杀人侦探”绫辻行人，异能名「Another」，是只要看穿杀人案的真相，凶手就必定会死于非命的异能。
小栗虫太郎，异能名「完美犯.罪」，可消除所有犯.罪痕迹。
辻村深月，异能名「昨日之影」，可将自身的影子实体化成异能生物攻击对手，一般情况下，异能生物整体看上去像一个长着羊角的兽人，但是轮廓不清楚，手持一把镰刀，但作为异能的主人，辻村深月完全不知道如何控制并驱动。
武装侦探社——
社长福泽谕吉，异能名「人上人不造」，可辅助社员控制自己的异能。
江户川乱步，无异能，却拥有堪比超越者的头脑，除武装侦探社社员的外界都认为其拥有异能「超推理」，可看破一切事情的真相。
国木田独步，异能名「独步吟客」，可撕下手册中的一页纸，写下任何他见过的并且大小不大于手册的东西，纸张就会变成所写物品的样子，并且拥有功效。
与谢野晶子，异能「请君勿死」，可将濒死之人救回，恢复健康身体。
谷崎润一郎，异能名「细雪」，可创造幻觉。
宫泽贤治，异能名「无畏风雨」，防御力强，力量强化。
织田作之助，异能名「天衣无缝」，可预测数秒内的未来。
田山花袋，异能名「棉被」，可用目光实现电子操控。
芥川龙之介，异能名「罗生门」，可操控布匹，布匹的刀刃可以撕裂空间。
港口黑手党——
森鸥外，异能名「VitaSexualis」，可化作异能生命体爱丽丝，可近战。
中原中也，被里世界称作“重力使”，异能名「污浊的忧伤之中」，异能可控，可进行重力操控，创造小型黑洞。
中岛敦，异能名「月下兽」，可进行肢体强化，撕裂异能，被里世界称作“白色死神”；泉镜花，异能名「夜叉白雪」，可化作人形带刀的异能体随从。二人常成双出现，一人在明，一人在暗。
尾崎红叶，异能名「金色夜叉」，可化作人形带刀的异能体随从。
广津柳浪，异能名「落椿」，可强力地推开手指触碰到的东西。
梶井基次郎，异能名「柠檬炸弹」，别名“柠檬花道”，可无视自己制作炸弹所造成的伤害，柠檬炸弹反而是副产物。
梦野久作，异能名「脑髓地狱」，让目标无差别攻击他人，前提是目标伤害过他。荒霸吐出现之前不可控。在制造荒霸吐的那场实验中，有一个研究者幸存，从那场实验中提取的能量可控制异能，目前只有港口黑手党掌握这项实验成品，严格把关从未外传。
至今为止，击败过MIMIC，苍王及其残党，组合，死屋之鼠等。
6月19日夜。
Lupin酒吧。
坂口安吾和织田作之助默契地在这里相遇。
每到这一天，二人都会不约而同地坐在这里，中间留出一个空座。
不知缘由。
二人不定期地在这里相会，从点头之交，到无话不谈的友人。
只是……
二人总觉得少了点什么。