赦免他们，没必要结一仇怨。"公孙度便放了刘政家人，邴原又出资送他们出了辽东郡，与刘政团聚。
因于邴原学问精深，加上情操高尚，短短一年时间，就有几百户人家迁居到他的住地附近，游学的士人，求学的孩童，施技的教授，穿梭往来，络绎不绝。
后来，辽东郡的治安开始不尽如人意，邴原便返回北海。其时孔融已经依附曹操，听说邴原已回，曹操征召他为司空掾。
公元208年，曹操的爱子曹冲突然病逝，曹操伤心欲绝。纯属凑巧，邴原的女儿也在这个时候病死。曹操得知，要求邴原将其女儿与曹冲合葬，意为阴配婚姻。邴原推辞说："合葬之举，不符礼仪。邴原之所以追随明公，明公之所以接纳邴原，是因为我与明公都能遵守规章制度。如果我这次听从明公之令，就说明我变得平凡庸俗了。将一个懂理懂礼的学者，变成一个俗人，明公认为这事值得去做吗？"曹操于是打消这个念头。
两年后，曹操调邴原为丞相征事。对于邴原在征事任内的政绩，时任曹魏东曹掾的崔琰，曾在自己推荐官职的奏记里叙述："征事邴原、议郎张范，都秉赋德行纯正美好，志向行为忠正端方，清廉洁净足可以激励凡俗，坚贞自守足以求取事功，正是所谓龙凤的羽翼，国家的重宝。推举任用他们，将使不讲仁德的人远遁。"
曹操每次出征前，常嘱曹丕："有事就向邴原与张范讨教。"正争世子之位的曹丕，便对邴原与张范执子孙礼。
有次曹丕宴请宾客，酒酣之时，他出了道难题："君主和父亲各自都有疾病，救命药丸只有一粒，是救君子还是救父亲呢？"宾客为表忠心，都说救君主，惟独邴原一言不发。曹丕追问邴原："你将药丸给谁？"
邴原答道："父亲！"曹丕倒也没有为难邴原。
不久，邴原代替凉茂的长史一职。自此之后，他闭门自守，非公务从不出门。公元214年，曹操征讨孙权时，邴原随军，不幸病逝途中，具体卒日不详。