袁世凯对复辟谬说并不想认真查究，因为他自己还想称帝，所以他把复辟的罪过嫁祸于国民党，认为这也是国民党的捣乱行为。
由于全国反对复辟的呼声鼎盛，袁世凯乃不得不于一九一四年十一月二十三日，下了一道严禁紊乱国体之邪说的命令。
宋育仁这时是国史馆编修，列名“内务部查办”的名单上。
查办本是官样文章，走走过场，不料宋育仁的运气太坏。他得罪了一个四川同乡，这位急于立功，竟向步军统领江朝宗对他指名道姓检举揭发。这样一来江朝宗不能不公事公办，派了一辆马车去接宋。
马车夫对宋育仁说：“统领大人请宋翰林到衙内走一趟。”
宋育仁心惊胆颤地去见到了江朝宗。
江朝宗含笑对这位编修说：“没有什么大不了的事，请芸子（宋的别号）先生写一篇答辩书，让我好交代。”
宋育仁应命写来：“劳乃宣着共和正续解，可采而有未恰，欲作一论驳其未能尽合而求其所以可行者。……欲援春秋托王称公之义，定名大总**称公，则其下卿、大夫、士有所统系。援春秋共奖王室之义，酌易‘待以外国君主之礼”，为‘上国共主’之礼，朝会有时。”这个答辩书显示宋育仁的应变之才，他的笔锋轻轻一转，就由复辟一变而为劝进。
在这之前，清朝遗老和复辟派都是当时最走红运的人物。由于严禁复辟谣言和宋育仁被传，因此情势为之一变。这些“苍髯老贼，皓首匹夫”人人自危，都怕蒙上复辟派之名而受连累。
这与二次革命失败后，西装革履的青年都怕犯有“乱党”嫌疑一样，实在是一个尖锐的对比。
这时，袁世凯的北洋系也摸不清袁心中的真实想法，他们也赶忙通电反对复辟。其中反对得最厉害的，却是留着辫子的张勋，他给袁的电报中这样说：“国事非等奕棋，政体岂同儿戏！”
内务部对袁的意图也不明所以，既然命令叫严行查办，他们也就不得不查办一下。
宋育仁案查办结果是：“议论荒谬，精神瞀乱，应遣回籍，发交地方官察看。”
可这个判决到袁世凯手中时，却被改为“劝回原籍休养”，派人致送程仪三千元，同时命令四川的地方官按月致送三百元，作为宋的休养费。
十一月三十日，步军统领江朝宗派秘书奚以庄护送宋育仁上车，宋育仁的知友纷纷到火车站来送行，还有不少人请宋育仁写屏联留作纪念。这样的排场才不像是“递解回籍”，简直是“衣锦荣归”。
湖北将军段芝贵接到徐相国密电，叫他对宋育仁要特别优待。
十二月三日宋育仁乘火车到达汉口时，段芝贵派警察备有四人大轿到车站迎接，又备有专轮把他接到武昌城；同时在清乡公所特辟精室款待。
而后段芝贵假口视察清乡成绩，到清乡总公所与宋育仁见面。
宋育仁在武昌等候他的眷属，共总住了八天。他在清朝做过湖北候补道，所以在湖北的老知交很多。后来他回到四川，袁世凯就撤销了对他“发交地方官察看”的处分。
前面提到劳乃宣曾写过信给赵尔巽。赵尔巽也是一位大遗老。民国三年袁世凯聘其为清史馆馆长，他原来是不肯出来做“两朝元老”的。
袁世凯骗他说：“这是替大清朝歌功颂德的事情，不是做民国的事情。”
赵尔巽随后提出一个条件，要替他的兄弟辩诬。
原来他的兄弟便是清末在四川任总督的赵尔丰，因对川民的保路运动大开杀戒，得绰号赵屠户。辛亥革命时被革命党所杀，赵尔巽要袁大总统替这位赵屠户昭雪。
袁世凯乃于民国年三月二十四日发布命令说：“据黑龙江护军使朱庆澜呈：前川督赵尔丰当武昌首义时，将政权交还士绅自治，商定条件，于辛亥年十月初六退职，初七悬挂国旗，公明退让，赞成民国，乃