还在战时指挥辎重军的工程部队，指导筑城和修建工事。
佥事判官厅是常设机构，负责枢密院的日常工作，相当于现代的综合办公室；职方司是从兵部端过来的，仍然负责地图的绘制和地形勘测；参议司就是个储才之地，相当于现代的军事委员会，他们的作用主要是平日协助枢密使制定战略、战策，对作战计划提供意见，战时可从中挑选领兵的将帅；督抚司此时只是空设，是为了指挥管理各战区预备的。
至于战区的重新调整划设，赵昺现在还没有想过，当下只有琼州这点地盘，也没有必要划分。而将来面对的却是整个沦陷区，不仅地理区域广大，且形势复杂。即使是抛开地域概念，按照未来战争可能生的方向来划分，而面对的战争存在着大宽度、大纵深的特点，一次大规模局部战争爆可能要动员全国半数地区的军事相关机构，所以还需细细谋划……
军事机关的大脑有了，那接下来身体，这就牵扯到了军队的编制问题。赵昺来到这个世界后，起初对宋朝的官制头疼的很，许多官名与现代不同便罢了，且职能也有的是以原意牛马不相及，让他费了好大的劲儿才搞明白怎么回事。而军队方面虽然简明了一些，可也颠覆了过去很多固有的观念，让他难以适从。
在现代军、师、旅、团、营、连、排、班的编制序列早已在脑子中根深蒂固，成为惯性，不用想就知道编制的大小。来到这个世界却乱了套，其实这些叫法古已有之，但是与现代，甚至当下也完全不是一个概念，而对应的军职也是千变万化，不下点功夫也弄不明白怎么回事。
中国自夏朝初期产生军队编制，由于社会政治制度的变革、生产力水平的提高和长期连绵不断的战争所影响，使得军队制极为丰富。现代军队编制一般都是统一的，在平时和战时的编制基本相同，要调动的话也是成建制的调动。但中国古代军队往往有两种编制，一种是平时组织训练的编制，另一种是战斗部队的编制。当要组建参战部队时需要打破原编制，将士兵重新组织到新的战斗编制中去。
中国古代军队的基本编制单位就是一五一十的“什伍”之制。另外古代展开军队作战时往往会排列成左、右两路或左、中、右三路的阵势，由此影响到军队要采用二进位或三进位，或其倍数的编制。
商代已经有了“什”的士兵编制，十个什由百夫长指挥；十什编为大行，由千夫长指挥；作战时习惯按照左、中、右各一个大行来排列阵势，投入战斗的三个大行就称之为“师”，是商代最基本战略单位。周代仍然以“师”为基本单位，进入春秋战国时期就比较乱套了，各国各自不同，但仍采用什伍制为基数。
汉朝步兵每五人编为伍，由伍长指挥；五个伍编为“两”，由两司马指挥；四个两编为卒，由卒长指挥；五个卒编为旅，由旅帅指挥；五个旅编为师，由师帅指挥；五个师编为军，由军将指挥。隋唐继承了府兵制度，各地遍设折冲府，为组织、训练的编制单位，管辖兵员八百至千人，设折冲都尉，副手为两位果毅都尉；府下辖数个团，每团兵员二百人，设校尉为主官；团下辖二旅，每旅兵员百人，设旅帅为主官；旅下辖二队，每队兵员五十人，设队正为主官；队下辖五火，每火兵员十人，设火长。
到后周时组建基本战斗部队编制：百人为一个都，都有都头；五都组编为一个营，营有指挥；五营即组编为一个军，军有都指挥使或都虞候，或直接称军主；十个军编为一厢，厢有都指挥使，或直接称厢主；左、右两厢编成一个战略方向的总兵力，一般大约为五万人上下，由皇帝派出的节度使统帅。
后周的制度被宋朝全盘沿用，宋军五百人为标准的营，一般直接称“指挥”，作为为基本单位，统计兵力都计算有多少指挥，调