与帝国皇帝很爽快的答应了李君威的北美殖民地处置方案不同，北美的战事却非常不顺利。
一开始，远征军南下征讨，还是挺顺利的，因为中部殖民地多是业主殖民地，比如纽约州，其实就是新约克，而所谓约克就是约克公爵，而这位约克公爵就是詹姆斯二世，而中部殖民地还是有不少天主教徒的，在李君威迫使菲茨詹姆斯同意理查德克伦威尔代管新英格兰殖民地之后，菲茨詹姆斯以费城为基地，建立了统治核心，略作安顿之后，继续南下，去占领富庶的南部殖民地。
实际上南部殖民地已经没有那么富庶了，尤其是最近几年，南部殖民地单一的热带作物种植遭到了来自帝国和巴西、西班牙等国同类商品的直接竞争，南部殖民地主要种植烟草、甘蔗和靛蓝，而这些商品同样在东南亚和东非、南美适合种植，尤其是环绕印度洋地区，随着苏伊士通道尤其是苏伊士铁路的开通，这些大量经济作物涌入欧洲，导致这些商品在欧洲的整体价格下降了很多。
虽然英国有《航海法案》为代表的贸易保护，但也有东印度公司这个漏洞，每年东印度公司都要从帝国购买相当数量的烟草与蔗糖，让英国内部市场价格也在降低，要知道，帝国种植这些经济作物的殖民地已经是经营几十年的，有些索性是帝国本土生产，虽然有运费上的劣势，但是在质量和技术上却是远远超过的，而安全的环境和更高效率的加工技术更是北美殖民地所不有的，因此最近几年，南部殖民地的经济萎缩了不少。
但是菲茨詹姆斯没得选，在帝国二十八年九月的时候，联军分海陆两支进入南部殖民地最大的城镇查尔斯顿，但很快就遭遇了反抗，因为菲茨詹姆斯不仅大规模提高税率，增加税目，来扩充他的军队，而且还实行严苛的宗教政策，导致殖民地的英国人纷纷武装抵抗，而在波士顿战役之中逃走的菲利普爵士联合各方，袭击联军。
而最大的失败发生在了查尔斯顿港，伪装成港口人员的反抗组织，偷袭了驻泊在港口内的远征舰队。这群人用几艘小艇改造成了杆雷艇，从外部看起来，与普通小艇没有什么不同，仅仅是船艏有一根木杆探入水底，这根长度超过十米的木杆上绑着一个爆炸物，里面装填了火药，采用两种击发方式，一种是以火帽为起爆物的触发引信，而火帽则是向远征军的士兵买的。另一种是燧发机改造的拉发引信。
因为水雷的密封问题，五艘杆雷艇最终只有两艘引爆，还有反抗组织成员参与放火，导致了远征舰队的巨大损失。
骏马级风帆巡航舰飒露紫号被一艘杆雷艇击中，炸出一个巨大的洞，因为风帆巡航舰没有水密舱室，战舰快速进水，被炸死、淹死的士兵达到了十四人。这艘船也因为龙骨受损，失去了修复价值，远征舰队仅仅是回收了船上的火炮和蒸汽机，就废弃了事。
装甲护卫舰铜墙号被杆雷艇击中右船舷，好运的是水雷炸在水线下的装甲带上，但也导致船壳受损，大量进水，但铁甲舰的水密舱室救了这艘船，但坏运的也是铜墙号，因为其靠在岸边，铜墙号遭遇了纵火袭击，导致船体大部分过火，这艘船原本就是用一艘巡航舰船体改造的，让船体大量被烧毁，还发生了火药库爆炸。但作为动力的蒸汽机却基本保持完好，最终这艘船也被废弃，蒸汽机被送往波士顿，被废物利用，最终被潘名器改造为了一艘浅水重炮舰。
在北美的战争之中，发生在查尔斯顿的袭击军舰是帝国远征军的最大损失，但同样也是北美英国殖民者反抗组织的最大损失。因为这场袭击，帝国只是损失了两艘军舰罢了，对于强大的帝国来说微不足道，但反抗组织却损失了最有威望的统帅菲利普爵士。
倒不是菲利普爵士死于袭击，而是死于袭击的后续反应。
袭击者使用的杆雷艇是菲利普爵士亲自参与改装的，以划桨为动力，以固定在水下长杆上的水雷爆