在春日部这个平凡又充满欢乐的小镇，野原一家正准备迎接一个特别的周末。美冴精心策划了一场家庭野餐，想着一家人能在郊外好好放松一下。小新呢，兴奋得在家里上蹿下跳，嘴里哼着自编的奇怪小曲，时不时还扭一扭他那标志性的屁屁舞。
“爸爸，快点快点，我们要去野餐咯，我都等不及要吃妈妈做的爱心便当啦！”小新一边催促着广志，一边把自己的玩具铲子和小桶塞进背包。广志无奈地笑着，慢悠悠地从房间里走出来，手里还拿着一本漫画杂志。
一家人终于出发了，坐在车上，小新看着窗外飞速掠过的风景，兴奋地喊着：“哇哦，外面的花好多呀，比妈妈买的菜还多！”美冴一边开车，一边叮嘱道：“小新，到了郊外可不能乱跑，要听爸爸妈妈的话哦。而且，路上的野花不要摘，知道吗？”小新敷衍地点点头，心里却在想着到了郊外要怎么玩个痛快。
当他们来到郊外的一片草地时，眼前的美景让大家都陶醉了。蓝天白云下，绿草如茵，五颜六色的野花星星点点地散布其中，微风拂过，花朵轻轻摇曳，仿佛在欢迎他们的到来。美冴找了个合适的地方，铺上野餐垫，开始摆放各种美食。广志则躺在一旁，继续看他的漫画。小新呢，早就像脱缰的野马一样，冲向了那片花海。
“哇，这里的花好漂亮啊，我要摘一朵送给妈妈。”小新说着，伸手就去摘一朵粉色的小花。就在他的手碰到花朵的瞬间，奇怪的事情发生了。那朵花突然变成了一个小小的花精灵，扇动着透明的翅膀，气呼呼地说：“你这个坏小孩，为什么要摘我，我在这里生活得好好的！”
小新吓了一跳，不过很快就恢复了镇定，笑嘻嘻地说：“嘿嘿，小花精灵，你好可爱呀，我只是觉得你很漂亮，想送给我妈妈。”花精灵皱着眉头，说：“你们人类总是这样，只想着自己喜欢，就随意破坏我们的家。告诉你，这片花海是有魔法的，被摘的花会给摘花的人带来麻烦！”
小新不以为然地吐了吐舌头，说：“才不会呢，我可是野原新之助，什么麻烦都不怕。”花精灵哼了一声，说：“那你就等着瞧吧。”说完，花精灵飞走了。
小新没把花精灵的话放在心上，他又摘了几朵花，蹦蹦跳跳地回到野餐垫旁，把花递给美冴，说：“妈妈，这是我送给你的花，漂亮吧！”美冴接过花，开心地说：“哇，小新真乖，不过妈妈不是说过路上的野花不要摘吗？”小新挠挠头，说：“可是它们太漂亮啦，妈妈你看，还有花精灵呢。”美冴以为小新在开玩笑，笑着摸了摸他的头。
然而，没过多久，麻烦就来了。天空突然变得乌云密布，一阵狂风刮过，原本平静的草地变得一片狼藉。野原一家都被这突如其来的变化惊呆了。广志站起身来，说：“这是怎么回事？天气预报没说今天有暴风雨啊。”
就在这时，一群黑色的花妖从四面八方涌了过来。这些花妖长得奇形怪状，张牙舞爪地朝着野原一家扑来。花妖们大声喊道：“你们这些破坏花海的人类，今天就是你们的末日！”小新这才想起花精灵的话，心里有点害怕，但还是鼓起勇气说：“你们这些丑八怪花妖，不准欺负我爸爸妈妈！”
广志和美冴也紧紧地护在小新身边，准备和花妖们战斗。可是，花妖们的数量太多了，野原一家渐渐有些招架不住。就在危急时刻，之前的那只花精灵飞了过来，它大声喊道：“你们先别冲动，听我说！”花妖们停了下来，看着花精灵。
花精灵对野原一家说：“我知道你们不是故意要破坏花海的，但是这片花海的魔法一旦被破坏，就会引发花妖们的愤怒。现在只有一个办法，就是你们要真心地向花海道歉，并且帮助我们恢复花海的生机。”小新连忙点头，说：“我们知道错啦，我们会帮忙的。”
于是，野原一家在花精灵和花妖们的指引下，开始努力恢复花海。他