5月16日，在稳定住东江镇以及皮岛的形式后，朝廷又加封明东江镇中后营左参将：沈世魁，为〈东江镇坐营左参将〉，明东江镇中后营右参将：张焘，为［东江镇坐营右参将］，明山东都指挥佥事：黄龙，为『东江总镇总兵』。
5月27日，后金天聪汗：爱新觉罗·皇太极、以后金先锋总兵：舒穆禄·楞额礼，为〔右翼主帅〕、后金三等总兵：那木都鲁·喀克笃礼，为〖左翼主帅〗，率领骑兵1千5百人、步兵4千5百人，又征调漠南蒙古、辽东汉军若干人，总兵力1万人，前往李氏朝鲜王国境内，开始打造船只准备进攻皮岛部与东江镇。
6月初4日，后金蒙古联军由李氏朝鲜王国宣川都护府分兵四路；一路入蛇浦、一路列兵身弥岛浦口、一路列兵郭山郡宣沙浦、一路奔嘉定岛。
以上后金蒙古联军所占四处，都在皮岛（李氏朝鲜王国叫；椴岛）东北至东面的沿海一线，从陆上也形成了对皮岛以及东江镇的半包围形势。
随后明东江总镇总兵：黄龙，就率领明东江镇坐营左参将：沈世魁、明东江镇坐营右参将：张焘，等将领统帅东江镇、皮岛以及登莱水师明军列兵海上。
一时间明军战船蔽海，连日开战，炮烟四起，声振天地，不仅击沉了后金蒙古战船无数，更是依靠船上的火炮火铳射击着岸上的后金军蒙古联军工事。
前后杀死后金蒙古联军乃至辽东汉军上千人，致使金军蒙古联军大败而撤，由此可见在毛总镇总兵被杀后不久的东江镇水师与登莱水师明军，仍具备雄踞渤海的海军力量，远非后金汗国所能匹敌的。
也让后金天聪汗意识到了大明帝国水师的强大作战力量。
7月初2日，明广东总镇巡按：高钦舜，疏奏称“广州府从化县（从化守御千户所）增从山居民：钟国相、陆彦博、颜丁髻，等刁民聚众数万造反，今通过剿抚并用，前后共斩一千一百余级，首犯：钟国相，等人已被歼灭。”
7月初8日，后金天聪汗集齐了诸贝勒大臣们商议，定官制，模仿大明帝国开始设立；户部、礼部、兵部、刑部、工部、吏部，由各旗贝勒们管理。
每部有承政分（蒙古承政、汉人承政），其下又设有参政八员，启心郎及笔帖式若干，各司其事，事不留行。
7月12日，后金镶红旗牛录额真：钮钴禄·库尔缠，被后金天聪汗赐予「巴克什」的称号，而这位后金镶红旗牛录额真兼巴克什：钮钴禄·库尔缠，却倾心汉文化，他认为身体发肤受之父母，不易轻剃，更不能损伤。
因此他本人是一直坚持留长发束衣冠的，不仅如此业余时间还曾与后金三等轻车都尉：觉尔察·达海，多次建议让后金天聪汗改穿汉服、蓄汉发衣冠，也使得后金天聪汗对其非常不满。
7月25日，首先由明登莱巡抚：孙元化，提议道“皮岛上兵于关外，应当尽早收复广宁卫、广宁前卫、广宁后卫、广宁左卫、广宁右卫、广宁中卫、广宁后屯卫、广宁右屯卫、广宁中屯卫（后金称锦州）、广宁左屯卫、义州卫，以及复州卫、海州卫、盖州卫，好恢复我大明辽东都指挥使司地盘威逼东虏建奴。”
因此明辽东总镇巡抚：邱禾嘉，就商议用皮岛与东江镇明军配合辽东军先收复广宁卫、广宁前卫、广宁后卫、广宁中卫、广宁左卫、广宁右卫、广宁后屯卫、广宁右屯卫、广宁中屯卫、广宁左屯卫、义州卫，而后在图辽南四卫。
然而明兵部尚书：梁廷栋，则考虑其难度，便先咨询明辽东总镇经略督师：孙承宗，打算听听他的意见。
明辽东总镇经略则表示道“广宁卫一带离海百八十里，去河西约有百六十里，陆运难，而义州卫又地偏，去广宁卫又远，必先占据广宁右屯卫，聚兵积粟