3月16日，明吏部文选清吏司郎中：赵南星，上奏称“如今大臣互相排挤，力谋权势，是为干进之害！正直之臣屡被斥逐去位，宵小之人得志猖狂，是为倾危之害，不问州府官员才行、抚按官员赃私不严惩，致使吏治日坏，民生日瘁，是为州府县之害，乡官之权，大于知县，横行无忌，莫敢谁何，是为乡官之害，若四害不除，则天下不可得治也。”
此举被内阁群臣们赞同以及明神宗：朱翊钧，的批阅准奏。
5月12日，明缅甸军民宣慰使司兼东吁王朝国主：南达勃因（汉名：莽应里）为报密堵城、送速城，这两地之怨，特派遣了幼子：明基囊，统兵10万人攻打孟养长官使司。
6月14日，漠南蒙古右翼多罗土蛮部首领：孛儿只斤·火落赤，率众四千铁骑进犯大明陕西承宣布政使司治下的洮州卫军民指挥使司。
当即就遭到了明洮州卫军民副总兵：李联芳，率军追击，但不幸遇伏战死！导致明军溃败，其中明洮州卫军民把总：何无衡，等将领均战死。
到了7月12日，漠南蒙古右翼多罗土蛮部首领又进犯临洮府首府河州（河州卫），并攻占了卫指挥所附近城楼。
致使明临洮府总兵：刘承嗣，连夜出战，却遭遇大雨兵败！导致明军损失惨重，才让漠南蒙古右翼多罗土蛮部能够成功劫掠内地二十多日，才匆忙退去。
随后漠南蒙古察哈尔部首领布延彻臣汗兼土蛮贵族黄台吉：孛儿只斤·卜言台周，也率部攻打辽东都指挥使司沈阳中卫，又深入到海州卫境内。
沿途大败明军守将，但明辽东总镇总兵：李成梁，却谎报军情。
另一边原本占据了朵甘都指挥使司的漠南蒙古右翼多罗土蛮部首领，又再次出兵牵制西部战线，攻打陕西承宣布政使司洮州卫军民指挥使司、河州卫地区。
在加上原本袄儿都指挥使司漠南蒙古右翼土默特部首领：孛儿只斤·卜失兔（大明顺义郡王兼漠南蒙古右翼土默特部彻辰汗：孛儿只斤·扯力克，长子）也率军迂回绕过陕西行都指挥使司西宁卫，前去攻打永昌卫。
欲断西域驻军后路，打算夺取陕西行都指挥使司所在地都司府地区，一时间大明西部边疆纷纷告急！也让明洮州卫军民总兵：李承芳，连忙上奏朝廷请求出兵支援。
随后明神宗：朱翊钧，特命明戎政尚书：郑洛，在陕西承宣布政使司平凉府固原州（固原卫总镇）扎营，并下令进军到陕西行都指挥使司永昌卫、西宁卫南川伏羌堡等地反击。
最终退敌十万人，明军大获全胜。
也致使大明顺义郡王兼漠南蒙古右翼土默特部彻辰汗：孛儿只斤·扯力克，不得不来大明帝国朝贡谢罪。
而另一位漠南蒙古右翼多罗土蛮部首领：孛儿只斤·火落赤，也被迫撤军，但却被大明革除了互市。
8月10日，明贵州总镇巡抚兼都察院右都御史：叶梦熊，上奏朝廷道“今播州宣慰使：杨应龙，不法诸事独霸一方，他所居府宅皆雕龙饰凤，又擅用阉宦，俨然是一个土皇帝，且为人狡诈多疑，好以诛杀立威，结怨甚深，其所辖五司七姓军民不堪其虐，纷纷叛离，此人还听信宠妾谗言，杀妻及岳母，又被其妻叔：张时照，上告罪状，因此臣力主勘问。”
但此时四川承宣布政使司松潘卫地区动乱不安，而播州宣慰使司兵力，又不断受调到外地协防，由此也引起了地方官府们的不安。
毕竟居心叵测之人，分兵镇守边疆实乃兵家大忌！
但是明四川总镇巡抚兼都察院山东道监察御史：李化龙，却认为边疆之地，本就需要兵力强悍之人镇守，故此奏请暂免勘问，导致黔蜀两地意见不一。
8月13日，明工部尚