随后农民军就去攻打平凉府华亭县，静宁州庄浪县，而官兵们则分头追捕，皆破获潜匿着的农民军。
先是延西诸寇被明陕西三边总督：洪承畴，下令诱降、招抚，荡清了部分流寇，仅有农民军；郝临庵、可天飞、刘道江，逃入庆阳府华池巡检司铁角城内躲着。
其中农民军：独行狼、李都司，还急忙赶过去同他们会合，可天飞、刘道江，就携手一起围攻庆阳府合水县。
好在明临洮卫总兵：曹文诏，及时前去援救，故此农民军当即就隐藏了自己的精锐部队，只让一千多骑兵出来迎战，还引诱明军抵达庆阳府合水县南原乡时，才伏兵大起。
而城上的农民军们大喜，纷纷呼喊道“呵呵！曹总兵这次死定了。”
话音刚落，就见到一杆银白色的金枪，从人群中杀了出来，农民军们仔细一看，就发现果然是曹总兵。
只见明临洮卫总兵拿着长枪，在敌人中间来回冲击，还单枪匹马被包围在万余名农民军中间。
各军见状连忙以火炮营轰炸，骑兵出击配合援助，致使农民军再次大败伏尸遍野，残余的农民军均逃往铜川桥去了。
之后明临洮卫总兵：曹文诏、明临洮卫左参将：曹变蛟、明凤翔守御千户：冯举、明甘肃总镇总兵：杨嘉谟、明西宁卫指挥使：方茂功，还追上他们冲锋陷阵，拼命厮杀让农民军又一次大败落荒而逃。
此刻陕西承宣布政使司境内的，原任朝廷明通政使：马鸣，上奏道“三秦为海内上游，延绥总镇、庆阳府为关中屏藩，榆林卫又为延绥总镇、庆阳府之屏藩，无榆林卫则必无延绥总镇、庆阳府，若无延绥总镇、庆阳府必无关中矣！乃自盗发以来破城屠野，四载于兹，良以盗众我寡、盗饱我饥，内鲜及时之饷，外乏应手之援，揆厥所由，缘庙堂之上，以延绥总镇、庆阳府视延绥总镇、庆阳府，未尝以全秦视延绥总镇、庆阳府，若以秦视秦，未尝以天下安危视秦，而且误视此流寇为饥民，势焰燎原，不可扑灭，若非亟增大兵措大饷，为一劳永逸之计，恐官军骛于东，贼驰于西，师老财匮，揭竿莫御，天下事尚忍言哉！乞敕所司，亟措饷二十万，给民牛种，为兵士犒赏，急图安戢，庶全秦安而各镇安矣。”
此奏章说出了陕西承宣布政使司的叛军与流寇之弱点，可惜朝廷官员们无一人能够听懂其中含义！
接着明山西总镇总兵：张应昌，出击围剿斩杀农民军：黄友才，暂时稳定住山西承宣布政使司境内的流寇局面。
2月10日，陕西承宣布政使司延绥总镇宁塞堡叛军们，再次死灰复燃，还煽动守军拉拢百姓扯旗造反，并连夜攻入延安府鄜州，斩杀明延安兵备道佥事：郭应响，劫掠延安府。
3月17日，农民军攻陷平凉府华亭县，而明华亭县知县：徐兆麟，刚刚赴任七日，在城陷之时，他竟然不顾百姓安危独自一人逃跑，也不组织任何抵抗！
以至于县衙衙役、捕快，以及县城守军们还没反应过来，就被农民军冲进城内拿下县城，城内军民们人人皆喊太冤。
4月初6日，湖广承宣布政使司流盗们开始进入江西承宣布政使司，活动于南安府崇义县与赣州府兴国县一带，又顺势北上流窜到吉安府泰和县、万安县、龙泉县（龙泉守御百户所）等处。
7月初3日，山西承宣布政使司农民军继续攻陷了平阳府隰州大宁县。
8月11日，明临洮卫总兵：曹文诏、明宁夏卫总镇总兵：贺虎臣、明固原卫总镇总兵：杨麒，在延安府甘泉县虎兕凹乡合力围剿，打败农民军大获全胜。
同时明陕西三边总督：洪承畴，下令胁从明军剿贼者免死，还招降了农民军四千人，解散者则有数千人，其余农民军皆散匿于山谷之中