共守长安，抗击叛军。於此战中，士孙瑞立下功劳。
初平三年，士孙瑞被拜为尚书仆射，与司徒王允、吕布共谋，诛杀董卓。
董卓既死，士孙瑞得迁大司农，跃身九卿之列。自此，每三公缺，士孙瑞常在选中，皇甫嵩、淳於嘉、赵温、杨彪、张喜等为公时，都曾辞拜让瑞。
却是说了，士孙瑞既然参与了杀董卓此谋，为何李傕、郭汜杀入长安后，没有像杀掉王允那样，也把他杀掉，为董卓报仇？这是因为，杀了董卓后，士孙瑞不仅由任王允自专此功，而且拒绝了封侯之赏，——这一点与贾诩颇为相似，有功不伐，故因是未被李傕、郭汜杀害，得以保存其身，继续在朝中为官。
简言之，士孙瑞此人，可以说是既有智谋，又有胆略见识，此时见司空张喜等俱皆不作声，郭汜眼看就要再度举刀胁迫，他遂徐徐出言，说道：“请将军息怒。”
“你有何话说？”
士孙瑞不慌不忙，从容说道：“仆等非是不愿为将军书此檄，而是仆等现下委实写不得此檄。”
郭汜问道：“为何写不得？”
士孙瑞说道：“要想传檄天下，檄文上岂可无张公诸府、仆等各官寺之落印？可是前时仆等来将军营时，是专为说和而来的，印章诸物，皆未携带。既如此，那便是将檄文匆匆为将军写就，然无印章，传於天下，又何取信於海内州郡？恐州郡亦不信矣！是以，此檄仆等现下不是不肯写，实是没法为将军写，写了也无用。”
郭汜坐回身子，说道：“无有印章……。”
士孙瑞说道：“车骑劫持天子，确乎悖逆，非人臣可为也，仆等与将军一样愤慨。将军欲号召天下群雄，共讨车骑，此扶助王室之义举也，仆等怎会反对？亦愿意为将军书写此檄。於下苦无印章在手耳！将军如果决心已下，仆等请还，待取印章，然后再为将军书此檄文。”
郭汜瞅了士孙瑞眼，咧开嘴，笑了起来，大模大样地呼士孙瑞的字，说道：“君荣，汝等总把我当三岁孺子糊弄，我今若把汝等放了回去，只怕汝等非只不会为我写此檄文，并也肯定不会再回来我营中了吧？”
士孙瑞端容正色，说道：“将军不信，仆等也没有其它办法了。”
没有印章，写不得檄文，这确是一个客观存在的麻烦。
如果派人去李傕营中取印章，这也肯定不可能。
郭汜思来想去，无有对策，此事也就只能暂且罢了。
带着不满意，郭汜回到住帐，见到其妻，发牢骚说道：“我听你的建议，把杨彪等扣在营中，原本以为是扣了一群宝，现在看来，却是一堆废物，半点也无用处！没有用处，还天天吃我的粮！这般算来，这实是一桩赔本的买卖。”
其妻面带喜色，说道：“正有一件好事与夫君说。”
郭汜问道：“什么好事？”
其妻从袖里取出一封书来，递给郭汜，说道：“夫君请看，这是什么？”
郭汜把书拿住，见那书封上头是空白的，并无落名，嘟哝说道：“谁的信，连个名都没
有。”拆开书封，取出里头的信来，略看两行，撑大了双眼，又从头看起，细细看了一遍，适才的恼怒不翼而飞，与其妻一样，也是面现喜色，说道，“天助我也！李傕死期至矣。”
……
杨彪险些被郭汜杀掉此事，消息隔绝，刘协现尚不知，然虽不知，自身被李傕劫困在营，宫城被烧，大司容朱俊恚怒而亡等等这些事情，盘杂心头，却还是使刘协愤懑忧郁，茶饭不思。
钟繇陪侍在帐中，温言劝抚刘协，说道：“陛下宜以龙体为重，今虽小困，然而待镇东兵到，困厄必然可解。臣伏乞陛下，放宽心思，千万不能因使龙体有恙。”
茶饭不思，一方面是因刘协心事重重，没有胃口；另一方面也是因李傕太不尊重刘协，送给刘协吃用的饭食粗陋不堪