眉州步军一则思乡心切，一则恐惧蒙军的残暴，现在裨将被杀，让他们更加人心惶惶。加之有“火狐”成员在军中暗中鼓动，这些士卒原本就是强征而来，在这群龙无首的情况下先是零星偷偷溜走，后来干脆乘夜哗变了。他们冲破蒙古骑兵的拦截，纷纷逃出营地四处散去。忽都虽然下令对哗变者格杀勿论，但大部分眉州兵还是在夜色掩护之下逃到了附近的低山丘陵之中。时值草木葳蕤的六月，一旦藏起来那里还能找到人。第二日天亮之时蒙军清点营中，发现那一千名眉州士卒只剩下几十人。
就在乐全安指挥水军旅围歼眉州水军之时，蒙军也在猛攻嘉定城，攻城的主力自然是新附军。自从忽都报来霹雳军即将南下的消息之后，纽璘一方面派人急召眉州水军回嘉定，只是信使尚未到达，刘大耳便兵败身死。另一方面他令手下的新附军强攻嘉定城，以图用人数优势击破守军的抵抗。此次围攻嘉定的新附军分为简州、隆州、雅州等各个派系，相互之间推诿扯皮。纽璘为了解决相互配合的问题，命各支新附军轮番上阵攻打，稍有懈怠便杀人立威。
曹知州是个老滑头，每次轮到雅州军上阵之时，他便派随征的夷蕃和青羌部族兵前去。最初几次夷蕃蛮兵倒是嗷嗷冲锋，他们一方面对曹知州刻意吹捧十分受用，另一方面也受城中的钱财和美女所诱惑。“重赏之下必有勇夫”，深谙此理的纽璘承诺，率先登城者，除官升三级赐良田千亩奴仆百人外，城中钱帛子女任其自取。这些夷蕃蛮兵世居之地都是高山峡谷之地，生活十分穷困，自然愿意拿性命来搏一搏功名与富贵。
只不过两日攻势下来，新附军不仅没有取得丝毫进展反而伤亡上千人，死伤最严重的便是夷蕃蛮兵。夷蕃蛮兵虽然勇武过人，也极擅攀爬城墙，但血肉之躯体却难敌火与铁，不到半日功夫他们便伤亡过半，再也不肯听曹知州的花言巧语了。简、隆等新附军也好不到那里去，也是伤亡惨重，以致城墙下仆倒数百具死尸。一时间新附军士气低落到了谷底，又开始畏缩不前起来。这一方面是巨大人员伤亡带来的寒蝉效应，另一方面是火器降维打击带来的绝望，这那里是攻城，纯粹是去送死。纽璘见状便又命斩杀攻城战中的溃逃之兵，一日之内竟然斩杀了数十人，这才堪堪维持住了攻势。
在蒙军车轮攻势下，嘉定城的形势越来越危急。虽然城中并不缺粮草，但攻城器械却在不断损毁，俞三带来的火器弹药也消耗殆尽，就连后来自制的黑火药也所剩无几。城中旧房虽然仍能刮不少火硝，但硫磺却是十分缺乏，以致侯兴带人将中药铺翻了个遍，也只找到数十斤硫磺，才又配制了几百斤黑火药。比缺乏守城物资相更严重的是守军已经疲惫不堪，昝万寿不得已抽调了大批民壮上城墙，自己也冒着矢石在攻防最激烈的一线指挥。这两日下来，他已是声音沙哑蓬头垢面，那里还有一丝风度翩翩的模样。
新附军一刻不停的用弩炮和投石机猛烈轰击嘉定城，也给城中军民造成严重的伤亡。自围城以来，守军死伤四百余人，民壮百姓伤亡三百余人，这些人多为箭矢和抛来石头所伤。协助守城的二百余人的霹雳军死伤了八十余人，伤亡率接近三分之一，连俞三也中了两箭，所幸伤势不重仍能躺在担架上指挥。那三艘武装商船和轻炮班的弹药耗尽后，水手和炮手也被编入特种连，和侯兴带领的亲兵队一起成为昝万寿手中最坚固的盾牌，屡屡被派到城防最危急的地方，这也是他们伤亡率如此之高的原因。
两千眉州军覆灭后，攻打嘉定的蒙军除去死伤的一千余人，仍有六千新附军和二千骑兵，即便面对霹雳军的上万兵力仍可一战。纽璘封锁了刘大耳兵败身死和眉州军哗变的消息，仍然强令新附军轮番攻城。只不过这两日高烈度的攻防战，使得双方的攻城器械都已消耗得差不多，嘉定守军又频频出城炸毁蒙军