韩遂等从汉阳郡的望垣县返回到同郡的冀城。七月，联军探部接二连三地传来信报：
兖州方面：
曹操部将陈宫听说刘岱战死后，前往州府治所山阳郡昌邑县劝说兖州别驾王彧、治中拥立曹操为兖州牧。
济北相鲍信便与州吏万潜等人到达东郡迎接曹操担任兖州牧。
本年五月，曹操认为黄巾军得胜后骄傲轻敌，于是在东平国寿张县东迎击黄巾军。初战不利。
黄巾众精悍，曹操兵寡弱。曹操对士卒安抚激励赏罚，设奇兵，昼夜会战，扰乱敌军，每战必有擒获，黄巾军这才退走。
但鲍信战死，时年四十一岁。
曹操悬赏寻找鲍信的遗体，没有找到。于是用木头刻出鲍信的模样，曹操洒泪祭之。
王允诏任的兖州刺史金尚带少量兵马这时来到兖州，将取代曹操。但当时兖州已发生巨变，被曹操占据。
朝廷方面：
六月二日（公元92年6月29日），大赦天下。
李傕等收司隶校尉黄琬，下狱，杀之。任命胡种接任司隶校尉。
李傕拘住王允后，恐左冯翊宋翼、右扶风王宏二郡为患，乃先征召宋翼、王宏入朝。
王宏遣使对宋翼曰：“郭汜、李傕以吾二人在外，故未危王公。今日就征，明日灭族，计将安出“
宋翼曰：“虽祸福难量，然王命，所不得避也！“
王宏曰：“关东义兵鼎沸，欲诛董卓，今卓已死，其党羽易制耳。若举兵共讨李傕等，与山东相应，此转祸为福之计也。“
宋翼不从，王宏不能独立，于是俱就征。一进长安，就被送交廷尉宣璠。
六月七日（公元92年7月4日），李傕收司徒王允及宋翼、王宏，并杀之。王允妻与子皆死，灭族。
王宏素与刚任司隶校尉的胡种有隙，及王宏下狱，胡种催促李傕杀之。
王宏临刑怒骂道：“宋翼竖儒，不足议大计！胡种乐人之祸，祸将及之。“
王允时年五十六。长子侍中王盖、次子王景、王定及宗族十余人皆见诛害，唯兄子王晨、王陵得脱归乡里，王允尚有一孙王黑留在家乡。
李傕弃尸王允于市，天子悲痛，庶民丧气，没有敢收尸者，平陵令京兆人赵戬弃官收而葬之。
刘表初平元年出任荆州刺史所办官印等都经时任典选举的尚书赵戬之手，赵戬数日后消失不见，据传去荆州投刘表了。
李傕等葬董卓于郿县，大风暴雨震董卓墓，水流入藏，漂其棺椁。
长安城破，城门校尉崔烈战死，其子并州西河太守崔钧因父亲去世丁父忧，又怕李傕等征伐，于是挂印弃官逃往荆州。
河东太守绵竹侯王宏乃王允之侄，亦弃官逃往并州北部。
河东郡一片混乱，白波军乘势南进，围攻河东太守治所安邑县县城。
李傕任命前司隶校尉赵谦出任前将军，带董卓旧部精锐骑兵去河东郡攻打白波军。
赵谦的家眷留在长安，不得不效力李傕。
两军在安邑城外展开激战，白波军大帅郭太受重伤去世，白波军受重创，撤围向北退去。
赵谦追击到白波军次帅杨奉占据的河东郡蒲子县、杨县、永安县，赵谦派与杨奉同为弘农华阴杨家的前河南尹杨懿去蒲子县杨家庄苑，说服杨奉归降了。
杨奉携部将徐晃及部分士卒随赵谦回长安。李傕表杨奉为城门校尉，接替崔烈；表杨奉长子杨敷为谏议大夫。杨敷子杨觽为御史中丞，杨觽次子杨纂为中大夫。
早在董卓进洛阳时，抓住潜入京城的杨觽，董卓未杀之，表任为谒者仆射，次年随帝迁都长安。故杨奉归降朝廷是迟早的事。
白波军余部在韩暹、李乐、胡才等带领下撤向并州太原郡。
赵谦派人将西河太守崔钧弃官出走后留守的西河郡离石县县长王邑和数千守军及