德辅朝廷，大庆方至，何惧之有！若淫刑以逞，将天下皆惧，岂独嵩乎！”
董卓的幕僚为了讨好彼，提出董卓可比姜尚（姜子牙），当称“尚父”。董卓向蔡邕求教，蔡邕则劝说董卓需要等到平定天下叛乱，返回洛阳后才能讨论，董卓听从。
董卓在长安城东开始修筑堡垒自居住，又调集数万劳力在自已封侯之地司隶右扶风郡郿县启动修筑坞堡。
坞堡设计高厚七丈，与长安城相等，号曰“万岁坞”，世人又称“郿坞”。
数月后，郿坞里初建成，里面存放大量搜刮来的财宝，并屯有三十年粮食储备。董卓自己说：“事成，则雄据天下；不成，守此足以过一生。”
一日，董卓出长安去郿坞，公卿大臣到长安城横门（横音光）外为其送行。
董卓立帐幔摆饮设款待众人，却在宴席上将数百名诱降来的北地郡叛军士兵虐杀。先断其舌，次斩手足，再凿其眼目，以镬煮之。
宴会上的人吓得战栗，勺子、筷子都掉了，而董卓依然饮食自若。
下属将领如果言语有冒犯董卓的，马上就会当场处死，董卓又以叛逆的罪名诛杀了一些关中旧族。
闻西河太守崔钧参与盟军，董卓于是收崔钧父前太尉崔烈入郿坞牢狱，锒铛铁锁锢之。
联军、马腾、盟军都与崔钧联络，崔钧夹在白马铜和白波军之间，又忌惮被关押的父亲性命而不敢作为，只固守离石县县城。
不少三辅望族向益州逃亡，投奔刘焉。
庶民不用董卓小钱，钱币崩溃，市场紊乱，物价飞涨，三辅民不聊生。
董卓调长水校尉沮俊管宫中侍卫。
调京兆尹常洽转任长水校尉，临晋侯杨彪从少府转太常，因病罢免，出任京兆尹，不久，又转光禄勋、光禄大夫。董卓最后选司隶京兆人金尚出任京兆尹。
董卓不想让盖勋长期掌禁军，颍川太守李旻被擒杀后，改越骑校尉盖勋出任颍川太守，去任的路上又招回。
盖勋重回到长安，越骑校尉一职已给了王颀，颍川太守一职给了吕布，盖勋重新任议郎。
盖勋虽强直不屈，而内心厌恶董卓，甚不得意。五月，盖勋背部发疽病逝，享年五十一岁。
盖勋临死前立遗嘱不接受董卓的任何馈赠，董卓则为了向众人展示自己的宽容，上书请朝廷赠送丧礼用品，陪葬于安陵。
安陵为前汉朝第二任皇帝惠帝刘盈的寝陵，刘盈乃汉高帝刘邦和汉高后吕雉嫡长子。
从前朝到本朝，得享在安陵陪葬的还有鲁元公主、张敖、陈平、张苍、袁盎、扬雄。张敖乃赵王张耳之子。鲁元公主乃刘盈同母亲妹，张敖妻。
六月二十三日（公元9年月日），长安发生地震，董卓向蔡邕询问应对，蔡邕趁机劝说董卓放弃乘坐青盖金华车，董卓听从，改成“皂盖车”。
董卓非常看重蔡邕的才学，十分厚待，每次有宴会，都会令蔡邕弹琴、主持，蔡邕都会努力匡正董卓的言行，董卓却很少采纳，蔡邕也觉得非常遗憾。
董卓入关去长安，留河南尹朱儁守洛阳，孙坚占洛阳后撤回鲁阳，而朱儁暗与盟军山东诸将通谋，又惧怕为董卓兵马袭击，于是沿孙坚撤军路线出奔荆州。
董卓以弘农郡华阴县杨家人杨懿为河南尹；朱儁得南阳袁术补给后复引兵还洛阳，击杨懿和洛阳令诸于，杨懿和诸于逃回长安。
董卓任并州刺史时杨懿任并州上郡定阳县县长，后来，杨懿追随董卓。
朱儁以河南尹洛阳周边残破无人烟、无军资，乃移师东屯于靠近陈留郡的河南尹中牟县，发书信给各州郡，请师讨董卓。洛阳令诸于重占洛阳。
徐州刺史陶谦上表朱儁为代理车骑将军，遣精兵三千助之，其余州郡亦赠朱儁些许兵马钱粮。
镇守河东郡安邑县的董卓女婿牛辅分遣其驻扎在司隶弘农郡陕县校尉李