，自然要归属两地新建的都指挥使司。
各地总领卫所的都指挥使司，明初是由五军都督府总领，土木堡以后，逐渐都听命于兵部。
这也就是说，朱由校差点把南直隶的兵权交给了兵部。
土木堡之变，致使全国的勋贵和武将力量几乎断代，自那以后，由勋贵和武将主理的五军都督府职权逐渐被兵部所取代。
文贵武贱的情况始于明初，到了英宗宣德年间愈发势盛，这里也有全国军权渐归兵部文官有关。
甚至于有些皇帝，都因为想要收回兵权而突然暴毙。
眼下大明就是这个情况，朱由校已经收回兵权的北直隶不算，全国上下，就只有原南直隶的京军亲卫大部分还听命于五军都督府。
五军都督府的左右都督，除非在南直隶屯驻，在它地几乎就是荣誉头衔，根本没有什么实权。
至于左右都督以下的佥事等职，现在就是个妥妥的闲差。
像是中原五省，辽东、山东等地，无论行都司还是都司，兵权悉已归于兵部。
天启元年王化贞和兵部尚书张鹤鸣造成的广宁之败，就是知晓战事的武将不能调兵，反要听命于文官，硬着头皮去打必输的仗，才酿成大祸。
其实到了现在，大明上下已经形成文官统兵，武将作战的习惯，无论眼下的孙传庭、卢象升，还是辽东的熊廷弼、洪承畴，都是如此。
无论日后五军都督府改制，还是全国卫所整顿，每一样朱由校在三年五年都做不完，眼下能做的只能是去适应。
朱由校在沉思时，有个人听这话可是高兴坏了。
这个人，就是明年将要袭爵的徐宏基嫡长子徐文爵。
他跨出一步，满面都透着红光，说道：
“陛下，臣觉得戚金说的十分有道理，不如就在江北、金陵两省设立行都司，归五军都督府统辖！”
“五军都督府由陛下直领，兵部也不至于越权。”
道理的确是这么个道理，可是朱由校看着阶下的徐文爵，怎么看都不像是刚死了亲爹亲娘的人。
就连这眼睛周围，也不像是真正伤心过该有的样子。
朱由校打量他半晌，总觉得徐文爵是有什么事瞒着自己，但也没有直接问，点头说道：
“如此最好。”
“由你们这些勋贵继续帮朕管着金陵、江北的兵权诸卫所，朕也能放心，只是江南大营的事…”
听见皇帝同意了，徐文爵更加高兴，忙抱拳道：
“臣愿为陛下效死，接替父亲，为陛下统领江南大营第三营！”
语落，就连黄得功都望向徐文爵，大大的脑门子画着大大的问号，小公爷刚死了亲爹亲娘，不是应该守孝吗.
“这么心急？”
朱由校笑着问道。
徐文爵没察觉出什么异样，但也是边哭边道：
“陛下，近几日臣常于家痛哭，心如刀割，可是陛下即将北归，南京诸勋贵中除我徐氏外，又没人能统领第三营。”
他犹豫片刻，方才说道：
“臣可以先领第三营，择期再为父母守孝！”
听到这些，朱由校仍旧含笑望着他，只是现在这副笑容中，已是透出了些许异样。