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西汉设置护羌校尉，很重要的意图是为了防止羌人与匈奴互通声气。
但随着匈奴势力被西汉驱逐出河西，这项任务逐渐不再吃重了。
而针对羌人不相统属的情况，监视羌人的动向就是要阻止各个部落解仇交质，联合反叛。
一有风吹草动，就可以警备，防止塞内外羌人勾结寇乱。
到东汉汉羌关系矛盾激化时，护羌校尉越来越加重军事征伐的力度。
各任护羌校尉屡屡自领重兵，还指挥地方郡守、都尉配合征剿屠杀反抗的羌人。
西汉护羌校尉治所设置在令居塞，是陇西通往河西大道的屏障，重兵驻守。
而东边的陇道所在水草肥美，南北诸羌相互交通，也是要冲。
羌人为反抗汉朝统治，也往往切断陇道，使河西、河湟、陇右与关中联系困难。
《后汉书·西羌传》记载：“先零别种滇零与钟羌诸种大为寇掠，断陇道。……东犯赵、魏，南入益州，杀汉中太守董炳，遂寇钞三辅，断陇道。”
“号多退走，还断陇道，与零昌通谋。”
对于汉廷来说，要控制羌人还必须比较有效地控制陇道。
显然保护交通是护羌校尉的重要职责。
护羌校尉的屯田有独立的体制，受农都尉管理，直属中央大司农，但也受属地领导。
早在赵充国领军平羌之初，就注意到在金城屯田的便利。
屯田在控制、稳定边境的任务中能起到政治抚绥、军事征伐所不能起到的作用。
屯田可以保障军粮供应，减少运输的开支；可以牢牢控制住当地的经济命脉，达到排挤羌人牧场、压迫羌人生存空间、威胁镇摄羌人的功能。
所以在赵充国之后，邓训、侯霸、韩浩等边吏都重视在金城屯田。
屯田成为护羌校尉的一项职责。
也常调动指挥军队驻扎屯田，征发各郡屯田兵配合治羌征羌部署。
如和帝永元元年(89)，护羌校尉邓训在降服诸羌后，遣还各郡屯兵，“唯置弛刑徒二千余人，分以屯田，为贫人耕地，修理城郭坞壁而已。”
顺帝永建六年(131)，护羌校尉韩浩为威逼群羌，“转湟中屯田，置两河间。”
护羌校尉为履行职责需要相应级秩，但以往研究多泛泛而论。
作者以为在边地复杂的行政运作和军事调度等级结构中，通过比较可以较准确认识护羌校尉官署组织的级别和地位。
据《续汉书·百官志五》亿载：“护羌校尉一人，比二千石。”
同秩类似的官职还有使匈奴中郎将、护乌桓校尉。
据《汉书·百官公卿表上》载：“西域都护加官，宣帝地节二年初置，以骑都尉、谏大夫使护西域三十六国，有副校尉，秩比二千石，丞一人，司马、候、千人各二人。”
《后汉书·匈奴传》中有提到西域都护但未说明品秩。
《汉官仪》说西域都护“秩二千石”，按西域都护初设为骑都尉、谏大夫的加官，骑都尉为“比二千石”；上述同类官职均为“比二千石”，因此《汉官仪》可能有误。
护乌桓校尉在《后汉书·乌桓传》中载：武帝“始置护乌桓校尉，秩二千石”，但《续汉书·百官志五》和《汉官仪》均记“秩比二千石”，综合判断也应是“比二千石”。
这四项官职性质都是边疆民族事务管理机构，均持节。
但西域都护、使匈奴中郎将在任务上似乎更艰巨，朝廷对西域、匈奴似乎也更为重视，都为之配备了副职“副校尉”，而护羌校尉、护乌桓校尉都没有副职。
据《汉书·百官公卿表上》载，西域都护“有副校尉”，这是由汉中央政府直接任命的都护副职，非都护自聘的幕僚。
权力很大，有时能发挥重大作用